Achievements

Pre-prints

  1. Inferring Timing of Infection Using Within-host SARS-CoV-2 Infection Dynamics Model: Are "Imported Cases" Truly Imported?
    Mar 31, 2020
    https://doi.org/10.1101/2020.03.30.20040519

Publications

  1. Revisiting the guidelines for ending isolation for COVID-19 patients
    Yong Dam Jeong, Keisuke Ejima†*, Kwang Su Kim, Shoya Iwanami, Ana I Bento, Yasuhisa Fujita, Il Hyo Jung, Kazuyuki Aihara, Koichi Watashi, Taiga Miyazaki, Takaji Wakita, Shingo Iwami*, Marco Ajelli
    eLife 10:e69340
    (2021)
    DOI: 10.7554/eLife.69340

  2. Detection of significant antiviral drug effects on COVID-19 with reasonable sample sizes in randomized controlled trials: a modeling study combined with clinical data
    Shoya Iwanami, Keisuke Ejima†*, Kwang Su Kim, Koji Noshita, Yasuhisa Fujita, Taiga Miyazaki, Shigeru Kohno, Yoshitsugu Miyazaki, Shimpei Morimoto, Shinji Nakaoka, Yoshiki Koizumi, Yusuke Asai, Kazuyuki Aihara, Koichi Watashi, Robin N. Thompson, Kenji Shibuya, Katsuhito Fujiu, Alan S. Perelson, Shingo Iwami‡*, Takaji Wakita
    PLOS Medicine 18(7):e1003660
    (2021)
    DOI: doi.org/10.1371/journal.pmed.1003660

  3. Mefloquine, a potent anti-severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2) drug as an entry inhibitor in vitro
    Kaho Shionoya, Masako Yamasaki, Shoya Iwanami, Yusuke Ito, Shuetsu Fukushi, Hirofumi Ohashi, Wakana Saso, Tomohiro Tanaka, Shin Aoki, Kouji Kuramochi, Shingo Iwami, Yoshimasa Takahashi, Tadaki Suzuki, Masamichi Muramatsu, Makoto Takeda, Takaji Wakita and Koichi Watashi
    Frontiers in Microbiology 12:651403
    (2021)
    DOI: 10.3389/fmicb.2021.651403

  4. Time variation in the probability of failing to detect a case of polymerase chain reaction testing for SARS-CoV-2 as estimated from a viral dynamics model
    Keisuke Ejima, Kwang Su Kim, Shoya Iwanami, Yasuhisa Fujita, Ming Li, Roger S. Zoh, Kazuyuki Aihara, Taiga Miyazaki, Takaji Wakita and Shingo Iwami (These authors contributed equally to this work.)
    Journal of the Royal Society Interface 18: 20200947. 20200947.
    (2021)
    DOI: 10.1098/rsif.2020.0947

  5. Estimation of the incubation period of COVID-19 using viral load data
    Keisuke Ejima, Kwang Su Kim, Christina Ludema, Ana I. Bento, Shoya Iwanami, Yasuhisa Fujita, Hirofumi Ohashi, Yoshiki Koizumi, Koichi Watashi, Kazuyuki Aihara, Hiroshi Nishiura and Shingo Iwami
    Epidemics 100454
    (2021)
    DOI: 10.1016/j.epidem.2021.100454

  6. Potential anti-COVID-19 agents, Cepharanthine and Nelfinavir, and their usage for combination treatment
    Hirofumi Ohashi, Koichi Watashi, Wakana Saso, Kaho Shionoya, Shoya Iwanami, Takatsugu Hirokawa, Tsuyoshi Shirai, Shigehiko Kanaya, Yusuke Ito, Kwang Su Kim, Takao Nomura, Tateki Suzuki, Kazane Nishioka, Shuji Ando, Keisuke Ejima, Yoshiki Koizumi, Tomohiro Tanaka, Shin Aoki, Kouji Kuramochi, Tadaki Suzuki, Takao Hashiguchi, Katsumi Maenaka, Tetsuro Matano, Masamichi Muramatsu, Masayuki Saijo, Kazuyuki Aihara, Shingo Iwami, Makoto Takeda, Jane A. McKeating and Takaji Wakita
    iScience 102367
    (2021)
    DOI: 10.1016/j.isci.2021.102367

  7. A quantitative model used to compare within-host SARS-CoV-2, MERS-CoV, and SARS-CoV dynamics provides insights into the pathogenesis and treatment of SARS-CoV-2
    Kwang Su Kim, Keisuke Ejima, Shoya Iwanami, Yasuhisa Fujita, Hirofumi Ohashi, Yoshiki Koizumi, Yusuke Asai, Shinji Nakaoka, Koichi Watashi, Kazuyuki Aihara, Robin N. Thompson, Ruian Ke, Alan S. Perelson and Shingo Iwami
    PLOS Biology 19(3): e3001128
    (2021)
    DOI: 10.1371/journal.pbio.3001128

  8. Should a viral genome stay in the host cell or leave? A quantitative dynamics study of how hepatitis C virus deals with this dilemma
    Shoya Iwanami, Kosaku Kitagawa, Hirofumi Ohashi, Yusuke Asai, Kaho Shionoya, Wakana Saso, Kazane Nishioka, Hisashi Inaba, Shinji Nakaoka, Takaji Wakita, Odo Diekmann, Shingo Iwami and Koichi Watashi
    PLOS Biology 18(7): e3000562
    (2020)
    DOI: 10.1371/journal.pbio.3000562

  9. Revealing uninfected and infected target cell dynamics from peripheral blood data in highly and less pathogenic simian/human immunodeficiency virus infected Rhesus macaque
    Hara A., Iwanami S., Ito Y., Miura T., Nakaoka S., and Iwami S.
    Journal of Theoretical Biology 479:29-36
    (2019)
    DOI: 10.1016/j.jtbi.2019.07.005

  10. A highly pathogenic simian/human immunodeficiency virus effectively produces infectious virions compared with a less pathogenic virus in cell culture
    Iwanami S., Kakizoe Y., Morita S., Miura T., Nakaoka S., and Iwami S.
    Theoretical Biology and Medical Modeling 14:9
    (2017)
    DOI: 10.1186/s12976-017-0055-8

Reviews, Books

  1. Iwanami S and Iwami S. Quantitative Immunology by Data Analysis Using Mathematical Models. Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology. Volume 2: 984-992. (2019). DOI: B978-0-12-809633-8.20250-1.

日本語文献

  1. 岩波翔也・キム・クァンス・藤田泰久・江島啓介・岩見真吾. 新型コロナウイルスの生体内感染動態の定量化とその応用/数理科学で挑む新型コロナウイルス感染症治療の確立. 数学セミナー. 2020年9月号 通巻 707号, pp33-39. 日本評論社. (2020).

  2. 岩波翔也、山本玲、岩見真吾、波江野洋. 骨髄球バイパスを含む造血システムの数理モデルを用いた1細胞移植実験のデータ解析. 数理解析研究所講究録. No.2087:77-85. 京都大学数理解析研究所. (2018). 京都大学学術情報リポジトリKURENAI(速報版).

  3. 岩波翔也、山本玲、岩見真吾、波江野洋. 骨髄球バイパスを含む造血システムの数理モデル. 数理解析研究所講究録. 京都大学数理解析研究所. (2017). 京都大学学術情報リポジトリKURENAI.

  4. 岩波翔也. 長期的な再生産能力を持った骨髄球系前駆細胞を含む造血システムの数理モデル. 日本数理生物学会ニュースレター. No.80 Supplement, pp.8. 日本数理生物学会. (2016).

  5. 岩波翔也. 長期的な再生産能力を持った骨髄球系前駆細胞を含む造血システムの数理モデル. 日本数理生物学会ニュースレター. No.79, pp.4-5. 日本数理生物学会. (2016).

Prizes

  1. Beautiful Poster賞, 2019年1月30日, 第13回九州大学システム生命科学府オールラボポスターコンテスト

Presentations

International conferences

  1. A quantitative comparison between hepatitis C virus JFH-1 and Jc1 by a PDE multiscale model of virus infection. Shoya Iwanami, Kosaku Kitagawa, Hirofumi Ohashi, Yusuke Asai, Koichi Watashi, Shingo Iwami. 9th International Congress on Industrial and Applied Mathematics (ICIAM 2019). Organizer: The International Council for Industrial and Applied Mathematics, Sociedad Española de Matemática Aplicada (SEMA). 開催場所:Blasco Ibáñez Campus of the Universitat de València, Valencia, Spain / 発表日:July 16, 2019 / 開催日:July 15, 2019 - July 19, 2019.

  2. Data analysis of single-cell transplantation. Shoya Iwanami, Ryo Yamamoto, Shingo Iwami and Hiroshi Haeno. 11th European Conference on Mathematical & Theoretical Biology and SMB Annual Meeting. Organizer: European Society for Mathematical and Theoretical Biology. 開催場所:The University of Lisbon, Lisbon, Portugal / 発表日:July 24, 2018 / 開催日:July 23, 2018 - July 27, 2018.

  3. Data analysis of single-HSC transplantation. Shoya Iwanami, Ryo Yamamoto, Shingo Iwami and Hiroshi Haeno. 2018 Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology & the Japanese Society for Mathematical Biology. Organizer: Society for Mathematical Biology and Japanese Society for Mathematical Biology. 開催場所:The University of Sydney, Sydney, Australia / 発表日:July 9, 2018 / 開催日:July 8, 2018 - July 12, 2018.

  4. Data analysis of single-cell transplantation using mathematical model of Hematopoietic system with myeloid bypass. Shoya Iwanami, Ryo Yamamoto, Shingo Iwami and Hiroshi Haeno. Viral Immune Dynamics Workshop. Organizer: Miles Davenport, The Kirby Institute, UNSW. 開催場所:The University of New South Wales, Sydney, Australia / 発表日:December 4, 2017 / 開催日:December 4, 2017.

  5. Mathematical model of hematopoietic system with myeloid bypass. Shoya Iwanami, Ryo Yamamoto, Shingo Iwami and Hiroshi Haeno. The 2017 Society for Mathematical Biology Annual meeting. Organizer: Society for Mathematical Biology. 開催場所:The University of Utah, UT, USA / 発表日:July 17, 2017 / 開催日:July 17, 2017 - July 20, 2017.

  6. Mathematical model of hematopoietic system with myeloid-restricted progenitors with long-term repopulating activity. Shoya Iwanami, Ryo Yamamoto, Shingo Iwami and Hiroshi Haeno. Systems Approaches in Immunology and Infectious Diseases. Organizer: The Center for Nonlinear Studies at Los Alamos National Laboratory. 開催場所:Santa Fe, NM, USA / 発表日:September 27, 2016 / 開催日:September 27, 2016 - September 28, 2016.

  7. Mathematical model of hematopoietic system with myeloid-restricted progenitors with long-term repopulating activity. Shoya Iwanami, Ryo Yamamoto, Shingo Iwami and Hiroshi Haeno. 10th European Conference on Mathematical & Theoretical Biology and SMB Annual Meeting. Organizer: European Society for Mathematical and Theoretical Biology and Society for Mathematical Biology. 開催場所:Nottingham, UK / 発表日:July 12, 2016 / 開催日:July 11, 2016 - July 15, 2016.

Domestic conferences

  1. 造血幹細胞分化における骨髄球バイパスの機能. 岩波翔也. 第29回日本数理生物学会年会. 主催者: 日本数理生物学会. 開催場所:東京工業大学大岡山キャンパス, 東京 / 発表日:September 14, 2019 / 開催日:September 14, 2019 - September 16, 2019.

  2. 造血幹細胞分化の数理モデルと1細胞移植実験のデータ解析. 岩波翔也. 第3回学際的がん研究夏の学校@別府. 主催者: 新井田厚司(東京大学医科学研究所). 開催場所:九州大学病院別府病院, 大分 / 発表日:July 27, 2019 / 開催日:July 27, 2019.

  3. マルチスケールモデルによるHCV感染動態の定量的解析. 岩波翔也. 第76回京都駅前セミナー. 主催者: 川上竜樹 (龍谷大学理工学部) , 森田善久 (龍谷大学理工学部), 村川秀樹 (龍谷大学理工学部), 岩見真吾 (九州大学大学院 理学研究院 生物科学部門). 開催場所:キャンパスプラザ京都, 京都 / 発表日:May 28, 2019 / 開催日:May 28, 2019 - May 29, 2019.

  4. HCV JFH-1株とJc1株の感染動態の定量的解析. 岩波翔也. 第16回ウイルス学キャンプ. 主催者: ウイルス学キャンプ実行委員会. 開催場所:ニューウェルシティ湯河原, 静岡 / 発表日:May 28, 2019 / 開催日:May 28, 2019 - May 29, 2019.

  5. 造血幹細胞移植実験のデータ解析. 岩波翔也. 新学術領域「細胞ダイバース」第2回若手ワークショップ. 主催者: 新学術領域「細胞ダイバース」. 開催場所:仙台秋保 岩沼屋, 宮城 / 発表日:February 28, 2019 / 開催日:February 28, 2019 - March 1, 2019.

  6. 造血幹細胞分化の数理モデルと1細胞移植実験のデータ解析. 岩波翔也. 第3回理論免疫学ワークショップ. 主催者: 岩波翔也(九州大学大学院システム生命科学府). 開催場所:秋田市にぎわい交流館, 秋田 / 発表日:January 24, 2019 / 開催日:January 24, 2019 - January 25, 2019.

  7. A comparison between HCV JFH-1 and Jc1 strains by quantitative analysis of infection dynamics. Shoya Iwanami, Kosaku Kitagawa, Hirofumi Ohashi, Yusuke Asai, Koichi Watashi, Shingo Iwami. Innovative Mathematical Modeling for the Analysis of Infectious Disease Data (IMAID 2018). 主催者: ID modeling group. 開催場所:Hanabishi Hotel, Hokkaido, Japan / 発表日:January 17, 2019 / 開催日:January 17, 2019 - January 18, 2019.

  8. 造血幹細胞移植実験のデータ解析. 岩波翔也. 文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究(研究領域提案型)「細胞社会ダイバーシティーの統合的解明と制御」(略称:細胞ダイバース)第3回公開シンポジウム「1細胞統合解析を駆使した組織内ダイバーシティー解明への挑戦」. 主催者: 文部科学省 科研費新学術領域研究「細胞ダイバース」. 開催場所:東京大学弥生キャンパス内弥生講堂・一条ホール, 東京 / 発表日:January 15, 2019 / 開催日:January 15, 2019.

  9. マルチスケールモデルによるHCV感染動態の定量的解析. 岩波翔也, 北川耕咲, 大橋啓史, 中岡慎治, 浅井雄介, 渡士幸一, 岩見真吾. 2018年度応用数学合同研究集会. 主催者: 日本数学会応用数学分科会. 開催場所:龍谷大学瀬田キャンパス, 滋賀 / 発表日:December 15, 2018 / 開催日:December 13, 2018 - December 15, 2018.

  10. A comparison between HCV JFH-1 and Jc1 strains by quantitative analysis of infection dynamics. Shoya Iwanami,Hirofumi Ohashi,Yusuke Asai,Koichi Watashi,Shingo Iwami. 第66回日本ウイルス学会学術集会. 主催者: 日本ウイルス学会. 開催場所:京都テルサ, 京都 / 発表日:October 29, 2018 / 開催日:October 28, 2018 - October 30, 2018.

  11. 造血幹細胞移植実験のデータ解析. 岩波翔也. 第15回「生物数学の理論とその応用」-次世代の数理科学への展開-. 主催者: 岩見真吾(九州大学大学院理学研究院). 開催場所:京都大学数理解析研究所, 京都 / 発表日:September 13, 2018 / 開催日:September 10, 2018 - September 14, 2018.

  12. HCV JFH-1株およびJc1株のマルチスケール感染の定量的研究. 岩波翔也、北川耕咲、大橋啓史、中岡慎治、浅井雄介、岩見真吾、渡士幸一. 第15回ウイルス学キャンプ. 主催者: ウイルス学キャンプ実行委員会. 開催場所:ニューウェルシティ湯河原, 静岡 / 発表日:June 6, 2018 / 開催日:June 6, 2018 - June 7, 2018.

  13. 1細胞移植実験のデータ解析. 岩波翔也、山本玲、岩見真吾、波江野洋. 第2回理論免疫学ワークショップ. 主催者: 岩波翔也(九州大学大学院システム生命科学府). 開催場所:富山県民共生センターサンフォルテ, 富山 / 発表日:February 3, 2018 / 開催日:February 2, 2018 - February 3, 2018.

  14. マルチスケールモデルを用いたHCV感染動態の定量的解析. 岩波翔也、北川耕咲、大橋啓史、中岡慎治、浅井雄介、渡士幸一、岩見真吾. 2017年度応用数学合同研究集会. 主催者: 日本数学会応用数学分科会. 開催場所:龍谷大学, 滋賀 / 発表日:December 15, 2017 / 開催日:December 14, 2017 - December 14, 2017.

  15. Data analysis of single-cell transplantation using mathematical model of hematopoietic system with myeloid bypass. 岩波翔也、山本玲、岩見真吾、波江野洋. 特別計画 RIMS 共同研究(公開型) 第 14 回「生物数学の理論とその応用」―構造化個体群モデルとその応用―. 主催者: 昌子浩登(関西学院大学理工学部数理科学科). 開催場所:京都大学, 京都 / 発表日:November 8, 2017 / 開催日:November 10, 2017 - November 10, 2017.

  16. Characterizing SHIV infection in vitro. Iwanami S. and Iwami S.. Innovative Mathematical Modeling for the Analysis of Infectious Disease Data (IMAID2017). 主催者: ID modeling group. 開催場所:Institute of Statistical Mathematics, Tokyo, Japan / 発表日:October 23, 2017 / 開催日:October 23, 2017 - October 23, 2017.

  17. Data analysis of single-cell transplantation using mathematcal model of hematopoietic system with myeloid bypass. 岩波翔也、山本玲、岩見真吾、波江野洋. 第27回日本数理生物学会年会. 主催者: 日本数理生物学会. 開催場所:北海道大学, 札幌 / 発表日:October 8, 2017 / 開催日:October 6, 2017 - October 8, 2017.

  18. Systems bone biology -骨の包括的理解から疾患制御へ-. 岩波翔也、中岡慎治、野下浩司、岩見真吾、篠原正浩. 第3回日本骨免疫学会. 主催者: 日本骨免疫学会. 開催場所:ANAコンチネンタルリゾートホテル, 沖縄 / 発表日:June 27, 2017 / 開催日:June 27, 2017 - June 29, 2017.

  19. HCV JFH-1株とJ6/JFH-1株の感染動態の定量的解析. 岩波翔也、北川耕咲、大橋啓史、中岡慎治、浅井雄介、岩見真吾、渡士幸一. 第14回ウイルス学キャンプ. 主催者: ウイルス学キャンプ実行委員会. 開催場所:ニューウェルシティ湯河原, 静岡 / 発表日:June 5, 2017 / 開催日:June 5, 2017 - June 6, 2017.

  20. 骨髄球バイパスを含む造血システムの数理モデル. 岩波翔也、山本玲、岩見真吾、波江野洋. 第3回数理生物学交流発表会. 主催者: 佐藤一憲(静岡大学大学院総合科学技術研究科). 開催場所:静岡大学浜松キャンパス, 静岡 / 発表日:February 19, 2017 / 開催日:February 19, 2017.

  21. 骨髄球バイパスを含む造血システムの数理モデル. 岩波翔也、山本玲、岩見真吾、波江野洋. 第1回理論免疫学ワークショップ. 主催者: 岩波翔也(九州大学大学院システム生命科学府). 開催場所:JMSアステールプラザ, 広島 / 発表日:January 19, 2017 / 開催日:January 19, 2017 - January 20, 2017.

  22. 骨髄球バイパスを含む造血システムの数理モデル. 岩波翔也、山本玲、岩見真吾、波江野洋. 2016年度応用数学合同研究集会. 主催者: 日本数学会応用数学分科会. 開催場所:龍谷大学, 滋賀 / 発表日:December 15, 2016 / 開催日:December 15, 2016 - December 17, 2016.

  23. 骨髄球バイパスを含む造血システムの数理モデル. 岩波翔也、山本玲、岩見真吾、波江野洋. RIMS研究集会 第13回「生物数学の理論とその応用」-連続および離散モデルのモデリングと解析-. 主催者: 大崎浩一(関西学院大学理工学部). 開催場所:京都大学数理解析研究所, 京都 / 発表日:November 16, 2016 / 開催日:November 14, 2016 - November 17, 2016.

  24. Mathematical model of hematopoietic system with myeloid bypass. Iwanami S., Yamamoto R., Iwami S. and Haeno H.. Innovative Mathematical Modeling for the Analysis of Infectious Disease Data (IMAID2016). 主催者: ID modeling group. 開催場所:Kobe University, Kobe, Japan / 発表日:October 12, 2016 / 開催日:October 11, 2016 - October 12, 2016.

  25. Mathematical model of hematopoietic system with myeloid-restricted progenitors with long-term repopulating activity. Iwanami S., Yamamoto R., Iwami S. and Haeno H.. The 2016 (16th) annual meeting of The Japanese Society for Mathematical Biology. 主催者: 日本数理生物学会. 開催場所:Kyushu University, Fukuoka, Japan / 発表日:September 9, 2016 / 開催日:September 7, 2016 - September 9, 2016.

Seminars

  1. 造血幹細胞移植の数理モデルと定量的データ解析. 岩波翔也. 岩手数理科学セミナー. 開催場所:岩手大学理工学部, 岩手 / 発表日:August 28, 2018 .

  2. Data analysis of single-cell transplantation using mathematical model of hematopoietic system with myeloid bypass. Shoya Iwanami. Seminar @Nakauchi Lab. 開催場所:Stanford University School of Medicine, Stanford, CA, USA / 発表日:July 25, 2017 .

  3. Mathematical model of hematopoietic system with myeloid bypass. Shoya Iwanami. ME seminar @Mathematical Biology Laboratory. 主催者: Mathematical Biology Laboratory, Kyushu University. 開催場所:Kyushu University, Fukuoka, Japan / 発表日:February 7, 2017 .

  4. Mathematical model of hematopoietic system with myeloid bypass. Shoya Iwanami. Seminar @Nakauchi Lab. 開催場所:Stanford University School of Medicine, Stanford, CA, USA / 発表日:October 3, 2016 .